Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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ERCC8Q13216 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
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ERCC8Q13216 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
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ERCC8Q13216 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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ERCC8Q13216 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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ERCC8Q13216 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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ERCC8Q13216 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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ERCC8Q13216 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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ERCC8Q13216 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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