Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PRDM2Q13029 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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