Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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NFX1Q12986 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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NFX1Q12986 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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NFX1Q12986 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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NFX1Q12986 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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NFX1Q12986 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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NFX1Q12986 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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NFX1Q12986 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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