Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
HOXD10P28358 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms