Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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HCN4Q9Y3Q4 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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HCN4Q9Y3Q4 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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