Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TPRNQ4KMQ1 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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