Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms