Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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