Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAMA4Q16363 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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