Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNA2Q15822 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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