Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
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