Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms