Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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