Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HTR4Q13639 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146 ms