Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRSQ13332 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms