Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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