Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
NR1H3Q13133 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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NR1H3Q13133 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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