Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 ULK4P1-202ENST00000565174 503 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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