Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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