Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms