Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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CNTN1Q12860 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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CNTN1Q12860 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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