Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXO1Q12778 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
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