Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPREP23469 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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PTPREP23469 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPREP23469 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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PTPREP23469 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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PTPREP23469 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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PTPREP23469 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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PTPREP23469 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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PTPREP23469 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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