Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
ATP9BO43861 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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