Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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