Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ANKRD54Q6NXT1 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54Q6NXT1 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms