Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 IFI44-201ENST00000370747 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 HLA-DQB1-AS1-201ENST00000419852 552 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 ZEB1-AS1-202ENST00000424191 320 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RPL10P6-201ENST00000457497 318 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC007849.1-201ENST00000469794 513 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 IGLV10-67-201ENST00000519446 325 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AP000916.2-201ENST00000528904 286 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC061975.3-201ENST00000583209 244 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 OR5AH1P-201ENST00000595968 283 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC078909.2-201ENST00000620584 398 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 MIR193BHG-210ENST00000641327 515 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 FANCL-203ENST00000403295 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 FO393411.1-201ENST00000325612 420 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 SNORA73B-201ENST00000363217 204 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AC074254.1-201ENST00000399152 404 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 VAV3-203ENST00000415432 1293 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ANKRD39Q53RE8 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms