Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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PTPROQ16827 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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PTPROQ16827 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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PTPROQ16827 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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