Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NDUFA9Q16795 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NDUFA9Q16795 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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NDUFA9Q16795 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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NDUFA9Q16795 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NDUFA9Q16795 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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