Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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HIF1AQ16665 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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HIF1AQ16665 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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HIF1AQ16665 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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