Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CTF1Q16619 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 628.7 ms