Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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SGCBQ16585 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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