Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
SSX1Q16384 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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SSX1Q16384 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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SSX1Q16384 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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SSX1Q16384 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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SSX1Q16384 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SSX1Q16384 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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