Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
NTRK3Q16288 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms