Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD8Q15843 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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