Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHRNA6Q15825 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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