Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ALX1Q15699 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms