Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TAF1AQ15573 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms