Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RYR3Q15413 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
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