Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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CNGB1Q14028 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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CNGB1Q14028 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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CNGB1Q14028 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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CNGB1Q14028 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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CNGB1Q14028 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CNGB1Q14028 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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