Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
TUBA3CQ13748 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms