Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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ERCC8Q13216 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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ERCC8Q13216 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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ERCC8Q13216 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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ERCC8Q13216 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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ERCC8Q13216 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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