Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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TRAF1Q13077 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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TRAF1Q13077 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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TRAF1Q13077 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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TRAF1Q13077 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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TRAF1Q13077 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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TRAF1Q13077 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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TRAF1Q13077 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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TRAF1Q13077 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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TRAF1Q13077 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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