Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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CNTN1Q12860 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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CNTN1Q12860 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNTN1Q12860 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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