Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EPHB4P54760 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms