Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SNX13Q9Y5W8 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SNX13Q9Y5W8 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SNX13Q9Y5W8 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SNX13Q9Y5W8 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SNX13Q9Y5W8 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SNX13Q9Y5W8 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SNX13Q9Y5W8 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SNX13Q9Y5W8 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SNX13Q9Y5W8 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SNX13Q9Y5W8 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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SNX13Q9Y5W8 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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SNX13Q9Y5W8 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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SNX13Q9Y5W8 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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SNX13Q9Y5W8 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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SNX13Q9Y5W8 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SNX13Q9Y5W8 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SNX13Q9Y5W8 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SNX13Q9Y5W8 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SNX13Q9Y5W8 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SNX13Q9Y5W8 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SNX13Q9Y5W8 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SNX13Q9Y5W8 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SNX13Q9Y5W8 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SNX13Q9Y5W8 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SNX13Q9Y5W8 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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SNX13Q9Y5W8 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SNX13Q9Y5W8 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SNX13Q9Y5W8 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SNX13Q9Y5W8 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SNX13Q9Y5W8 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SNX13Q9Y5W8 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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