Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.3 ms