Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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SPOCK3Q9BQ16 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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SPOCK3Q9BQ16 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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SPOCK3Q9BQ16 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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SPOCK3Q9BQ16 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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SPOCK3Q9BQ16 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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