Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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