Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIDA1Q1XH10 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms